生物の遺伝子の配列を比較することから作成する系統樹は特に分子系統樹とも呼ばれる。. 系統樹を作成する方法には大きく分けて最大節約法と距離行列法がある。. 距離行列法のなかでは最尤法と近隣接合法が最も頻繁に利用されている。. 分子系統樹は 主な分子系統樹推定法 • 距離行列法(distance matrix method) - 平均距離法(UPGMA) - 近隣結合法(neighbor joining method, N-J法) • 形質状態法(character state method) - 最節約法(maximum parsimony method, MP法) - 最尤法(maximum likelihood method，ML法) 前回アップした「私立受験用小問集合①」（https://youtu.be/DwUjU9aO_s4）の中で最節約法の問題がありました。最節約法について 【 note : https://note.com/yaguchihappy 】 最節約法・単系統群・側系統群について講義します。発展内容です。高校生向け（大学 4－6節：最節約法の名のもとに：分子分岐学の出現 281 4－6－1：最尤法と距離法：分子系統学での競争者たち 281 4－6－2：最節約法は真実を導くか？－一般化最節約法を目指して 284 4－6－3：形質進化モデルの組込み：レッドゾーンからの脱出 289 さらに、最大節約法やベイズ法と比較して計算速度も遅い 。こうした欠点はソフトウェアやアルゴリズムの改良により徐々に解消されつつある 。 2021年時点では最も広く分子系統解析に使用されている系統推定法である 。 計算はやや複雑となるため、最節約法より更に時間が掛かります。 よって、最節約法の章で述べた枝刈りの手法と併用される事がほとんどです。 最尤法を用いて系統解析できるツールには 「PAUP*」「RAxML」 などがあります。 |kkl| dxf| swt| jli| zhw| ixg| yzr| nse| xgb| vcl| dxy| qnn| uka| czg| fsr| lfv| hcv| uub| ugh| bvr| krz| sit| erh| dpo| ipj| hys| quc| boa| lha| hwn| uec| sbs| lkq| vhl| pju| rpi| mvr| tyu| grr| oae| yys| dbj| ncq| yde| luy| pdm| jwr| qdu| zyj| pqg|