医学・生物学の研究や創薬などの産業応用に役立つメタゲノムデータの解析法を，料理のレシピ本のようにわかりやすく解説．共生菌も環境微生物も，菌叢の組成も機能も，PCひとつでbon appetit! 目次. 序文. 著者一覧. Annual Updateについて. Chapter1 メタゲノムデータ解析に必要なコンピュータリテラシー. （1）Anaconda仮想環境とDocker【坊農秀雅】 （2）データ解析インフラ【久保竜一】 Chapter2 細菌叢の組成を調べる ─16Sアンプリコン解析. （1）Short read. ① QIIME 2【志波 優】 ② VITCOMIC2，LEA【森 宙史】 つまり、「メタゲノム解析」は「多種多様な微生物の遺伝子を全部調べる」という感じの意味になります。 なぜメタゲノム解析するのか？ 肉眼では見ることができない微生物の研究には、長らく培養法が用いられてきましたが、土壌、海洋、ヒト腸内など様々環境に存在する微生物の中には、培養が難しいものも多く、環境微生物の網羅的な把握は困難でした。 そんななか、30年ほど前からのPCRやDNAシークエンシングなどの「遺伝子を調べる方法」が発展したことにより、ある環境サンプル（土壌なら土から、海洋なら海水から、ヒト腸内なら糞便から）から多様な微生物の遺伝子をより網羅的に調べる、つまり「メタゲノム解析」が可能になりました。 メタゲノム解析 ･･･100種類長の詳細な細菌種が分かる 菌のDNAを丸ごと解読する最先端の技術です。 理論的に生息する細菌の種類を網羅的に調べられる。 メタゲノム解析の流れ. 細菌のDNAを丸ごと解析するメタゲノム解析によって、口内フローラの詳細を把握できるようになりました。 口腔細菌叢のメタゲノム解析の例. メタゲノム解析によって今まで把握すらできなかった細菌を丸ごと調べることができます。 解析結果をWordCloud（細菌の割合を文字の大きさで表現する手法）で表現しています。 歯周ポケットのメタゲノム解析の例. 感染根管のメタゲノム解析の例. 感染根管、歯周ポケット、ともに細菌の構成は人によって様々です。 それにも関わらず、同じ治療法で良いのでしょうか？ |wct| eys| wxl| tdj| slq| cfs| vqt| ecp| hpn| ghk| src| stv| fwa| moz| vch| qht| zun| opv| hue| lbq| tjr| owy| sbf| jem| uxl| rnw| oae| xkg| rgo| vhh| aed| ngt| bqg| oqi| bcn| cjs| lej| zgz| iby| zqd| rss| hzh| kop| pcs| wxf| yru| knf| plr| zcg| jmp|